古代打仗時,軍事家常言“兵馬未動、糧草先行”;在以4P醫(yī)學為主導(dǎo)的年代,“認知醫(yī)學遺傳學”上也有一句名言——“疾病未現(xiàn),診斷先行”。近日,GEN網(wǎng)站深度解析了奧巴馬的精準醫(yī)療項目中應(yīng)用到的下一代測序(NGS)技術(shù),后者在精準醫(yī)療中的地位不可或缺,可謂是精準醫(yī)療的“先行者”。
醫(yī)療改革一直是美國政府的面臨的巨大痛點,近些年美國國會的激進醫(yī)改措施幾乎讓民眾失去了信心和度量標準。
根據(jù)WHO2000年發(fā)布的統(tǒng)計報告,美國醫(yī)療系統(tǒng)的健康產(chǎn)出、響應(yīng)能力及公平性在統(tǒng)計的191個國家和地區(qū)中排名37;2014年,彭博社發(fā)布報告稱,美國在統(tǒng)計的51個醫(yī)療效率期望滿意度的國家中,排名31。
多種力量聚合,催生醫(yī)療改革史“完美風暴”
由于2014年是基因測序的元年,2015年迎來了基因測序的大年,奧巴馬政府提出的“精準醫(yī)療”與不同的力量聚合,將會迎來醫(yī)療改革史上的“完美風暴”。
新的力量聚焦于以下5個方面:
1.醫(yī)護服務(wù)質(zhì)量的提高和患者健康體驗的提升;
2.對疾病治療向健康管理轉(zhuǎn)變;
3.醫(yī)保補償體系的轉(zhuǎn)變;
4.醫(yī)療保險的覆蓋度;
5.先進診斷技術(shù)的可及性及過度治療的防范措施。
GEN網(wǎng)站如此評論道,盡管美國的醫(yī)改體系嘗試過無數(shù)的模型,但是距今為止,最高雅的概念則是4P醫(yī)學,即預(yù)測性、預(yù)防性、個體化和可分享性,該詞匯由LeroyHood博士創(chuàng)造,他是當代遺傳學的提出者和倡導(dǎo)者,積極地推崇系統(tǒng)生物學在醫(yī)療中的應(yīng)用。。
對4P醫(yī)學發(fā)展的政策支持
在4P醫(yī)學中,對一些高發(fā)型疾病的可預(yù)測性和個性化離不開現(xiàn)代分析診斷技術(shù),為提高診斷的準確性和先進技術(shù)設(shè)備在大規(guī)模群體中的應(yīng)用,奧巴馬政府在“精準醫(yī)療”項目中已經(jīng)下達了以下措施:
1.NIH至少招募100萬的志愿者進行前沿性的醫(yī)學和疾病的研究診斷(提供1.3億美元資助);
2..NIH進一步研究惡性腫瘤的驅(qū)動基因和針對特定分子靶標的治愈機制(提供7000萬美元資助);
3.CFDA組織建立高度有效的大型數(shù)據(jù)庫,提升個體化醫(yī)療/精準醫(yī)療和公共衛(wèi)生質(zhì)量(提供1000萬美元資助)
4.美國協(xié)調(diào)委員會衛(wèi)生信息技術(shù)部(NCHIT)建立統(tǒng)一的標準和方法,以保障數(shù)據(jù)的安全傳輸(提供500萬美元資助)。
NGS技術(shù)在精準醫(yī)療中的角色
基因檢測技術(shù)(尤其是NGS技術(shù))在臨床診斷中應(yīng)用,對腫瘤患者的疾病診斷和治療作用巨大。根據(jù)基因診斷的結(jié)果,可以設(shè)計出伴隨診斷藥物治療方案,來判斷某類藥物是否對患者有作用。
自從NGS技術(shù)可以同時分析成千上萬區(qū)域的的數(shù)百個基因,因此其在判斷腫瘤基因突變中(尤其是在驅(qū)動基因引起的突變中)成為了一個理想的工具。例如,NGS技術(shù)被用于患者的基因篩查在一種新型的叫做“baskettrial”的臨床試驗中,作為一種新型的基于新靶標的癌癥篩查辦法,是傳統(tǒng)病理學診斷難以媲美的。
NGS技術(shù)在精準醫(yī)療中的顯著挑戰(zhàn)
盡管NGS技術(shù)在精準醫(yī)療中的應(yīng)用屬于“認知醫(yī)學遺傳學”的重要部分,但是它仍然面臨諸多挑戰(zhàn):有來源于倫理學上的,還有的來自數(shù)據(jù)庫等基礎(chǔ)設(shè)施方面的。
未通過相關(guān)的正式法案
精準醫(yī)療的目標之一就是為NGS診斷建立現(xiàn)代化的管理平臺。FDA批準的診斷包括HER2,KRAS、EGFR、ALK和BRAF等基因突變,對乳腺癌基因表達的預(yù)測等,診斷試劑盒皆是通過了CLIA認證,但至今尚未有NGS腫瘤診斷產(chǎn)品獲得可FDA510法案的上市前批準(PMA)。
認知深度有待進一步研究
毫無疑問,傳統(tǒng)的診斷方式將會被擁有更大的genepanels的NGS技術(shù)所取代,對驅(qū)動基因的驅(qū)動突變的診斷,使得對癌癥的分子診斷有了多重假設(shè)性,這對個體的治療作用顯著。某類癌癥是由單個基因驅(qū)動的突變,還是多種癌癥類型是多個基因以同樣的突變方式表達等機制尚不清楚(早期結(jié)直腸癌是由于體細胞突變引起的,同時又存在由于驅(qū)動基因引起的體細胞突變的機制,從生物學的角度,這種機制的作用不是遞進的),關(guān)于NGS技術(shù)在腫瘤診斷中的應(yīng)用有待進一步研究,“認知醫(yī)學遺傳學”的系統(tǒng)方法是掌握這些腫瘤分型的多重突變或者誘因的重要手段。
操作規(guī)程上存在的不足
在操作上,目前存在的最大挑戰(zhàn)是良好操作規(guī)范(GMP)的事實,這些樣本包括小型分析,非侵入性樣品、樣本的預(yù)處理、組織樣本的分析和堅定、儀器和軟件的驗收與選擇、公共數(shù)據(jù)庫的使用、不同醫(yī)療層級的測序數(shù)據(jù)觀察、數(shù)據(jù)儲存等等。
倫理學上的爭議
除上述挑戰(zhàn)之外,倫理學問題也是一個重要的挑戰(zhàn):一方面,當NGS檢測報告的結(jié)果與患者及家人臨床表現(xiàn)不一致時,隨后帶來的風險問題居多;另一方面,警察局、法院等司法機構(gòu)能否擁有公民基因組信息時也存在巨大爭議(盡管法院可以通過DNA比對排除犯罪嫌疑人,但是在法律上這或許早成了對公民基因信息權(quán)的侵犯)。
NGS技術(shù)在精準醫(yī)療中的近期目標
長遠來看,NGS最終絕對是用于臨床基因組診斷的先鋒,一些突變采用免疫組織化學診斷的方式根本無法實現(xiàn),例如診斷BRAF(V600E)、EGFR(L858R)、EGFR突變中19號外顯子的刪除和ALK突變等。
除了癌癥治療以外,多種醫(yī)學治療皆會從基因組分析中獲益。例如早在2010年,威斯康辛醫(yī)學院就通過全基因測序?qū)雰旱幕蛐揎?,成功治愈了一名基因突變兒童。從此之后,許多兒童醫(yī)院紛紛效仿,通過全基因組測序測定新生兒突變。
由于精準醫(yī)療項目的實施,各個機構(gòu)及公司對收集用戶基因組信息的熱情達歷史性新高度。由于基因信息的多重表達性,該計劃或?qū)⒅π难芗膊『吞悄虿〉某梢蛲诰?。已?jīng)有研究證明,個人的微生物組與包括肥胖等人體多種疾病息息相關(guān),基于基因組信息的多重分析將會對糞便移植在內(nèi)的一些新型療法產(chǎn)生作用。
NGS技術(shù)在精準醫(yī)療中的未來探索
基因是開啟生命殿堂的鑰匙,但并不是獨有的鑰匙,也不是個體化醫(yī)療和預(yù)見性用藥的獨家武器。
除了醫(yī)療保健部門,一些健康人壽保險公司甚至更加關(guān)心基因檢測的應(yīng)用,他們甚至通過基于客戶的基因分析數(shù)據(jù)來決定投保人的保費。在基于“認知醫(yī)學遺傳學”的治療系統(tǒng)尚未建立之前,保險公司還不能建立合適的補償措施和風控機制。
綜上所述,大部分人還無法看清NGS技術(shù)在精準醫(yī)療中的作用和地位,有人認為處在爆發(fā)點的前夜,也有人認為它正處在風口上。無論如何,筆者可以肯定的是,隨著基因組數(shù)據(jù)的累積,人類能夠增加對多種疾病的深層次認知。